AMD (NASDAQ: AMD) y el socio tecnológico Penguin Computing Inc., una división de SMART Global Holdings, Inc. (NASDAQ: SGH), han anunciado hoy que la Universidad de Nueva York (NYU), el Instituto Tecnológico de Massachusetts (MIT) y la Universidad Rice son las primeras universidades que han sido designadas para recibir sistemas de computación completos de alto rendimiento impulsados por el Fondo HPC de AMD para la investigación de COVID-19. AMD también anunció que contribuirá con un sistema basado en la nube impulsado por los procesadores AMD EPYC y AMD Radeon Instinct ubicados en el sitio de Penguin Computing, proporcionando capacidades de supercomputación remota para investigadores selectos en todo el mundo. Combinados, los sistemas donados proporcionarán colectivamente a los investigadores más de siete petaflops de potencia de cálculo que pueden ser aplicados para la lucha contra el COVID-19.
«La tecnología de computación de alto rendimiento desempeña un papel fundamental en la investigación viral moderna, profundizando nuestra comprensión de cómo funcionan los virus específicos y, en última instancia, acelerando el desarrollo de posibles terapias y vacunas», dijo Lisa Su, presidente y CEO de AMD. «AMD y nuestros socios tecnológicos se enorgullecen de proporcionar a los investigadores de todo el mundo estos nuevos sistemas que incrementarán la capacidad de computación disponible para la lucha contra el COVID-19 y respaldarán la futura investigación médica».
Se espera que las universidades receptoras utilicen la nueva capacidad de computación en toda una gama de cargas de trabajo relacionadas con la pandemia, como la genómica, el desarrollo de vacunas, la ciencia de la transmisión y la elaboración de modelos. Además, los científicos de todo el mundo que realizan investigaciones sobre el COVID-19 pueden solicitar acceso al grupo de HPC en la nube impulsado por AMD en Penguin Computing presentando propuestas a través de COVID-19HPC@amd.com.
Compromiso con las universidades
Las universidades receptoras están preparando ahora sus planes de investigación e infraestructura para recibir los sistemas, incluyendo la definición de proyectos de investigación específicos que puedan tener un impacto tanto a corto como a largo plazo.
NYU
«La pandemia de COVID-19 ha tenido un profundo impacto en la investigación de la educación superior, tanto en términos de su dirección como en la necesidad de resultados inmediatos, por lo que el momento de esta donación es particularmente fortuito, y estamos tremendamente agradecidos a AMD», dijo Russel Caflisch, director del Instituto Courant de Ciencias Matemáticas de la Universidad de Nueva York. «Los recursos informáticos donados por AMD serán utilizados por los investigadores de la NYU de una amplia gama de disciplinas en proyectos para abordar las muchas facetas importantes de la crisis de COVID-19, incluyendo: el descubrimiento de fármacos que pueden ser terapéuticos para COVID-19 y las futuras mutaciones del virus del SARS, la recuperación de resultados de investigaciones relevantes de la vasta literatura biomédica, el análisis de imágenes médicas para la detección en pacientes, y el análisis de actitudes políticas y comportamiento electoral en respuesta a las dificultades financieras».
MIT
«En todo el MIT estamos trabajando para hacer frente a la pandemia mundial de COVID-19, desde la que tiene un impacto inmediato, como la elaboración de modelos, las pruebas y el tratamiento, hasta la que tiene un impacto a medio y largo plazo, como el descubrimiento de nuevas terapias y vacunas. Casi todo este trabajo involucra la computación, y mucho de ello requiere el tipo de computación de alto rendimiento que AMD está proporcionando tan generosamente con este regalo de una máquina Petaflop», dice Daniel Huttenlocher, decano del Colegio de Computación Schwarzman del MIT.
Rice
En el Centro de Física Biológica Teórica, el investigador de Rice José Onuchic está utilizando sus estudios previos sobre la gripe A como guía para explorar cómo las proteínas de superficie del coronavirus facilitan la entrada a las células humanas, el primer paso crítico de la infección. Otro científico, Peter Wolynes, está utilizando principios de sus teorías fundacionales sobre el plegamiento de proteínas para examinar miles de moléculas de medicamentos e identificar los mejores candidatos para las pruebas clínicas en función de su grado de unión a las proteínas de superficie del virus.
«El regalo de la AMD será verdaderamente trascendental para el ataque computacional de Rice a COVID-19», dijo Peter Rossky, decano de la Escuela de Ciencias Naturales Wiess de Rice. «Tenemos los métodos para progresar, pero los estudios de sistemas grandes y complejos están a la vanguardia de la viabilidad computacional. La contribución de la AMD de una dedicada y avanzada potencia de cálculo supondrá un cambio en la aceleración del progreso para derrotar a este virus».
Socios del ecosistema AMD
AMD se ha unido a la conocida firma de soluciones HPC y AI Penguin Computing para definir, construir y suministrar los sistemas en las instalaciones y el clúster Penguin on Demand (POD), impulsado por AMD. El soporte POD de Penguin Computing será colocado en el espacio del centro de datos donado por el Banco de Datos. Las contribuciones de Penguin Computing, NVIDIA, Gigabyte y otros están ayudando al Fondo HPC de AMD para avanzar en la investigación de COVID-19.
«Penguin Computing» está deseando apoyar y contribuir a los esfuerzos de investigación de COVID-19 a través de esta colaboración con AMD. Estamos comprometidos a proporcionar nuestras aplicaciones y experiencia tecnológica en computación de alto rendimiento, inteligencia artificial y análisis de datos tanto a la Universidad en las instalaciones como a nuestros entornos de la nube de POD remotos», dijo Sid Mair, Presidente de Penguin Computing Inc.
«Las velocidades de datos ultrarrápidas y el procesamiento inteligente de los datos son fundamentales para proporcionar la información que la ciencia exige, especialmente en estos tiempos difíciles», ha señalado Gilad Shainer, Vicepresidente senior de marketing de redes Mellanox en NVIDIA. «Las soluciones Mellanox HDR 200 gigabit InfiniBand de NVIDIA proporcionan alta velocidad de transmisión de datos, latencia extremadamente baja y motores de descarga de aplicaciones que aceleran las simulaciones biocientíficas y favorecen el desarrollo de tratamientos contra el coronavirus».
Gigabyte está suministrando sus nodos de computación G290-Z21 para los clusters de Penguin, construidos alrededor de un único procesador AMD EPYC 7642 de 48 núcleos emparejado con ocho aceleradores de GPU Radeon Instinct MI50. Los nodos de gestión del sistema R182-291, también de Gigabyte, utilizan cada uno dos procesadores AMD EPYC 7302 de 16 núcleos.
El compromiso de AMD con la investigación de COVID-19
El Fondo HPC de AMD para COVID-19 se creó para proporcionar a las instituciones de investigación recursos informáticos para acelerar la investigación médica sobre COVID-19 y otras enfermedades. Además de las donaciones iniciales de 15 millones de dólares en sistemas de computación de alto rendimiento, AMD ha aportado tecnología y recursos técnicos para casi duplicar el sistema de cúspide del programa «Corona» del Laboratorio Nacional Lawrence Livermore, que se está empleando para proporcionar potencia de computación adicional para la elaboración de modelos moleculares en apoyo de la investigación sobre el COVID-19.
